马友友除了不断在音乐舞台上带给观众全新的感受，更致力于音乐教育的推动。他不但鼓励青少年接触音乐，更希望他们进一步参与创作。巡回演出期间，马友友都会排出时间指导大师班学生，甚至参与学生(包括非音乐科系学生)一些非正式的活动。同时，他也发展“家庭音乐会”，如在卡内基厅一系列“家庭音乐会”开幕中演出；在“Mr. Roger's Neighborhood”及“芝麻街”等电视节目中，带领小听众群进入音乐世界。马友友竭尽所能地为儿童塑造一个音乐的空间，以丰富而生动的方式让音乐与创造力成为儿童生活中的一部分。
在1999年的夏天，马友友与名指挥巴伦波因合作，和一群来自中东的优秀杰出年轻音乐家们组成的“中东青年管弦乐团”一起演出研习，活动名为“1999文化之城”，于德国威玛举行。
马友友使用的两把乐器分别为1733年制Montagnana大提琴及1712年制Davidoff Stradivarius大提琴。
美国东部时间2009年1月20日，马友友在美国总统奥巴马的就职典礼中演出。在拜登宣誓就职后，马友友在音乐家约翰·威廉姆斯和伊扎克.帕尔曼小提琴协奏下，为广大观众演奏。此后，奥巴马手按林肯当年宣誓用的《圣经》宣誓就职，并发表就职演说。
马友友最主要演奏乐器是一把1733年、在威尼斯组装的Montagnana大提琴，名为Domenico，要价250万美元，昵称为Petunia，马友友曾有一次将它遗留在纽约的计程车里。後来找回且并未受损。马友友的另有一把原属杰奎琳·杜普蕾的大提琴，是一把罕见的斯特拉迪瓦里大提琴，名为“Davidoff”。杜普蕾病重不能演奏后，这把琴就被借给马友友演奏。后来杜普蕾去世后，该琴被拍卖，新的买家虽然不知何人，但这位收藏家仍然决定将此琴继续借给马友友使用。除此之外，他还拥有一把碳纤维制成的大提琴，制作公司为波士顿的Luis and Clark。
马友友目前正在制作他的丝绸之路计划，目标是结合来自历史上由丝绸之路所连结的各国音乐家，唱片的发行者是新力古典（Sony Classical）2009年1月20日，马友友在美国第44任总统奥巴马的就职仪式上领衔表演四重奏，四重奏由马友友、小提琴家伊扎克·帕尔曼、钢琴家盖布莉叶拉·蒙泰罗（Gabriela Montero）与单簧管家安东尼·麦吉尔（Anthony McGill）共同担纲。
作品风格
评论家认为马友友“无所不奏”（omnivorous），比一般的古典音乐家更为兼容并蓄。马友友非常重视与小听众的接触，经常参与到音乐教育的各种活动中来，并鼓励青少年多多接触音乐，思考音乐和创作音乐。
