笛管，笛头和按键上可以用软布将污渍除去但除去按键之间的污渍是不明智的。横杆、弹簧和按键很容易在清洗时变形所以最好不要管它。
经常实用的长笛容易磨损，需要定期进行维修和保养。普通的磨损和划伤对衬垫的破坏比长笛其他部分更严重。经过一定时间后自然会漏气。所以对衬垫进行微调或更换会减少漏气，使长笛保持良好状态。轻微，仔细的操作能衬垫使用几年。常规保养一般包括清洗和对按键上油使按键几年内保持灵活不至于过度磨损。笛头内的软木塞经过一段时间会收缩，失位，造成漏气或音不准。一般来说，职业长笛家每年将他们的乐器拿到维修店进行常规保养和维修。建议你每年进行一次常规维护。
在对长笛进行定期维护时维修人员会将按键取下来对乐器进行全面清洗。
