通常情况下，附管音与同级主管音应该是相同音高，有的葫芦丝主管音与附管音出现偏差，两个音同时发声时，感觉很刺耳，这时首先需要确定一下到底主管音是否从听觉上已经准确，再来确定一下附管音到底是偏高还是偏低。
在相差不大的情况下，可采用压孔法来确定，如：先用手指盖住附管音一部分，打开主管3音孔，并同时吹响两个音，边吹边将盖住附管音的手指慢慢抬高，如果手指未完全打开的情况下感觉两个音很统一了，那么，说明附管音高了；另一方法是附管音完全打开，用手指盖住部分主管3（Mi）音孔，同时吹响两个音，盖住3（Mi）音的手指慢慢担起，当未完全打开3（Mi）音孔时，感觉两个音统一了，这时，可以断定附管音偏低。附管音偏低可将附管削去一点点，或将管孔边缘挖掉一点点，这样附管音会升高。
如果附管音偏高，则需要用一根较细竹棍由附管管口处插入，并触到附管调音塞，轻轻将调音塞往里推一点点（根据偏高的具体情况来确定调节深度），一次只允许推进最多一毫米（多推使音偏低，又要削去一截管口），边调整边试吹直到准确为止。一般情况下，附管音音准比较好的时候，在开附管演奏所有音阶时，从听觉上总的感觉都比较舒服。
